Notruf Hafenkante spielt im Hamburger Polizeikommissariat 21 (PK 21). In einer Folge werden mehrere Geschehnisse verarbeitet. So kann es sowohl um die Entführung eines Kindes als auch um Diebstahl gehen. Die Polizisten arbeiten dabei eng mit den Ärzten des Elbkrankenhauses (EKH) zusammen, da sich ihre Fälle immer wieder dort verknüpfen. Dienststellenleiter Polizeioberrat Wolf Haller und sein Team leisten die polizeiliche Ermittlungsarbeit; Dr. Jasmin Jonas, die Nichte des ehemaligen Revierleiters Polizeioberrat Martin Berger, und ihre Kollegen leisten medizinische Hilfe, gleichgültig, ob es sich um Opfer oder Täter handelt. Insgesamt dreht es sich bei Notruf Hafenkante um eine Verstrickung aus zwei verschiedenen und doch nahen Berufsalltagen und dem Privatleben der Retter.