La historia de Kanokon gira alrededor de Kouta Oyamada, un joven de primer año de secundaria que se muda a la ciudad y se transfiere a la secundaria Kunpo. En su primer dia en su nueva escuela, una hermosa chica de 2ndo año llamada Chizuru Minamoto le pide que la vea en el salon de musica. Cuando el llega, ella le confieza que ella en realidad es una zorra de naturaleza divina y desde ese dia los dos empiezan a andar juntos.