Nagato Yuki-chan no Shoushitsu est un spinoff de La Mélancolie de Haruhi Suzumiya. Yuki Nagato est une élève studieuse, c'est la présidente du club de littérature. Malgré cela, elle est assez renfermée sur elle-même et n'est jamais très sûre d'elle autour d'autres personnes. Alors quand elle côtoie Kyon, le seul garçon du club fraîchement arrivé, Yuki se retrouve encore plus mal à l'aise que d'habitude. Elle va devoir trouver confiance en elle et laisser sa vraie personnalité briller !