A história do anime gira em torno de uma garota solitária do ensino médio chamada Momo, que frequenta uma escola de ensino médio na cidade de Sorasaki. Sem o conhecimento de todos, Momo é uma agente que trabalha para a agência de inteligência privada Tsukikage, que protege a cidade e seu povo. Sob a tutela de Yuki e seus outros amigos, eles mantêm a paz na cidade.