Dinho, Lia e Ju são vizinhos e, elas duas, melhores amigas. Os três cresceram juntos, estudam juntos e compartilham a descoberta do amor. Aventuras, encontros e desencontros testam seus valores quando as duas, que sempre foram confidentes, descobrem-se apaixonadas pelo mesmo menino e sofrem para preservar a amizade acima de tudo. Nesta temporada, Malhação ganhou um novo colégio, o Quadrante. É uma escola pública que preza pela excelência de ensino, cujo acesso se dá por uma prova classificatória, permitindo o convívio de alunos de diferentes realidades. É lá que os jovens passam a maior parte de seu tempo. Partindo do triângulo amoroso formado pelos três protagonistas, a trama se desdobra em histórias paralelas que são concluídas a cada duas semanas. O tema do novo ano gira em torno das pequenas grandes escolhas feitas na adolescência.