Embora esta série TV tenha sido lançada depois dos OAVs de Tenchi Muyo OAVs, tudo está diferente. Tenchi Universe é como uma versão alternativa de toda saga Tenchi. Várias garotas surgem de diferentes partes da galáxia e, de alguma forma, fazem o possível para entrar na vida pacata de Tenchi. Temos a Ryoko, a famosa pirata espacial; Aeka, a primeira princesa do planeta Jurai; Mihoshi e Kiyone, duas detetives espaciais atrapalhadas... adicione mais uma cientista maluca, mais uma princesa alienígena, alguns inimigos ameaçadores e você terá uma série cheia de aventuras chamada Tenchi Universe. Mas o que é isso? Parece que Tenchi tem origem alienígena também!